تم تأسيس قسم العلوم الطبية التطبيقية عام 1985 لمواكبة سوق العمل ورفد السوق المحلي والدولي بالكفاءات اللازمة لتغطية الاحتياجات الطبية.

يتميز قسم العلوم الطبية التطبيقية بالمرافق والمختبرات المجهزة بأحدث التقنيات المواكبة للتطورات التي تحدث بالمجالات الطبية والمحاكية لسوق العمل، إضافة إلى وجود تخصصات فريدة من نوعها مثل بكالوريوس تقنيات صناعة الأسنان، الدبلوم الدولي في التمريض المشارك والرعاية الصحية، الدبلوم المحلي في مختبرات الأسنان وفحص البصر وتجهيز النظارات الطبية وغيرها من التخصصات.

جميع تخصصات قسم العلوم الطبية التطبيقية تُدرس باللغة الإنجليزية لتمكين الطالب من العمل والتطور في هذه المجالات، كما يعتمد تدريس الطالب على دمجه بالعملية التعليمية أولًا وتدريبه على جميع الوسائل والأدوات المستخدمة بسوق العمل، حيث أن الخطط الدراسية صُممت بعناية ليغطي الجانب العملي بنسبة مرتفعة وليكون الطالب قادرًا على الانخراط بمجال عمله بسرعة.

يقدم قسم العلوم الطبية التطبيقية ستة تخصصات تندرج تحت برامج البكالوريوس والدبلوم الدولي والدبلوم الجامعي المتوسط. وهذه التخصصات معتمدة من قبل أكثر من جهة وهي وزارة التعليم العالي، مؤسسة بيرسون وهي مؤسسة تعليم ونشر بريطانية مختصة في خدمات التقييم للمدارس وكليات المجتمع والجامعات عالميًا، وأيضًا جامعة البلقاء التطبيقة على التوالي.